More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3300 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3300  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 400 aa  779    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1176  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.07 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394639  normal  0.0393311 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.95 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.98 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.98 
 
 		 399 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.71 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.81 
 
 		 396 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.02 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.07 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.47 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.35 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.7 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.7 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.46 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.46 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.46 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.46 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.5 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.46 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.7 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.7 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  29.7 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.7 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.7 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.7 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.47 
 
 		 415 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.74 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.97 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  35.96 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323105 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.17 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  32.26 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.44 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.16 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.84 
 
 		 401 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.1 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  33.07 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  33.07 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.99 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.05 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.34 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.43 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.89 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.6 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  31.3 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.42 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.53 
 
 		 370 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  33.88 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.23 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.27 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.92 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.25 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_009665  Shew185_2373  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.409175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1974  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.24 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0583224  hitchhiker  0.00000495427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.98 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.84 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.08 
 
 		 410 aa  150  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 440 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00781  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_2488  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0118329  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.66 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.39 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.5 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.84 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  30.75 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.96 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.79 
 
 		 461 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1751  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0172421  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.16 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.26 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.09 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1831  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.03 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2268  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.12 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  32.17 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.17 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.74 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.04 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  33.59 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  33.33 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.82 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.84 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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