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for query gene Mlg_1176 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1176  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 412 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394639  normal  0.0393311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3300  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.8 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.62 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.93 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.2 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.28 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.04 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.25 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.85 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.36 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.36 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.6 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.44 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.61 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.1 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.31 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.93 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.12 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.35 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  28.35 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  33.84 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  34.37 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323105 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  33.84 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.87 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.6 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.92 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.6 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.51 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.13 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.77 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.96 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  33.07 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.03 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.93 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.05 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.45 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.17 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.99 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.14 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.92 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.99 
 
 		 398 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.34 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.35 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.68 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.41 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.84 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.9 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.15 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.37 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.37 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  32.9 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.81 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.91 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.98 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.14 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.61 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  31.69 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.35 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.21 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.51 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.85 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  30.93 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.66 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.04 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 461 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  30.37 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.41 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 		 498 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.15 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  29.89 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.25 
 
 		 426 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.49 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.81 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.05 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.18 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.76 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.67 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  30.53 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.7 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.43 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.5 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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