116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0324 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  747    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  32 
 
 
398 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  30.62 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  29.66 
 
 
412 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
419 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  31.27 
 
 
413 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  28.61 
 
 
419 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
471 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.68 
 
 
450 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  30 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  27.62 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.8 
 
 
450 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  23.75 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.93 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  23.75 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  21.22 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  23.75 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.37 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  22.85 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.83 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.83 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.32 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.25 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  22.11 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.29 
 
 
423 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.3 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.3 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  21.32 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 
405 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
435 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.04 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.04 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.04 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.04 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  23.58 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  26.29 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.01 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.14 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.25 
 
 
423 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  23.87 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.24 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  22.95 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  20.67 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  23.26 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.07 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.51 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.23 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.4 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  22.63 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  22.63 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  22.63 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  22.63 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  22.63 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  24.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  22.98 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
428 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25.69 
 
 
414 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  26.29 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  26.29 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  26.29 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
411 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.29 
 
 
412 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 
397 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
395 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4065  major facilitator superfamily transporter  30.33 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
464 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.62 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  24.36 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  26.64 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  30.53 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  27.86 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  25.43 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  27.4 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.64 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  23.5 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>