228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5855 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  84.73 
 
 		 419 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  84.73 
 
 		 419 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 420 aa  812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  86.81 
 
 		 421 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  85.71 
 
 		 420 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  78.54 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  78.54 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  78.54 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  63.96 
 
 		 422 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  63.48 
 
 		 422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  66.67 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  51.09 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 426 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  54.39 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 		 413 aa  346  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4504  hypothetical protein  66.42 
 
 		 158 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 477 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  29.16 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  28.71 
 
 		 401 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  29.16 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  29.16 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  29.16 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  29.16 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  29.44 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  29.2 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  28.43 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  29.56 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  29.56 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  29.56 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  29.57 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  29.32 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  27.43 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  29.32 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  29.32 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  29.32 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  29.32 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  29.32 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  29.32 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  25.18 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  25.18 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  29.21 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.64 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  25.31 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.7 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.7 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.64 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  28.78 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.81 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.57 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  30.54 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  27.52 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.21 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.37 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.01 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  26.59 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  27.64 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  26.19 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  34.07 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  26.19 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  26.19 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  32.93 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  25 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  22.04 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  32.32 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  31.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  31.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  31.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.59 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>