161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0291 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 415 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 415 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  48.68 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  38.07 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 413 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 420 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  38.52 
 
 		 420 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  38.56 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  39.25 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  28.42 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  27.78 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  27.78 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  27.78 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  27.78 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  27.78 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  27.78 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  27.78 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  27.78 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  30.89 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  29.74 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  29.74 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  29.74 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  28.76 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  28.76 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  28.76 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  28.76 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  28.76 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  28.76 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  28.73 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  28.27 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  28.43 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  26.27 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  23.47 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  23.47 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  23.32 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.54 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  23.27 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.27 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.98 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.02 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.76 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  30.42 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  20.28 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  19.52 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  19.52 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  19.52 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  20.22 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  19.52 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  19.52 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.77 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  18.88 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  21.26 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  19.52 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.06 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.12 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  27.35 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.12 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  18.47 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  20.62 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  18.21 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  19.63 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.79 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.81 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  21.51 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.51 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>