237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3674 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 452 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  29.23 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.97 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  27.17 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.32 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  20.98 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.04 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.25 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.43 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.75 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  21.21 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  26.88 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  21.93 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.58 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  21.39 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  22.08 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  20.43 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.86 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  20.32 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  20.32 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  34.56 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.01 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.01 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  20.29 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  21.73 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  25.29 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.29 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  25.29 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  19.53 
 
 		 418 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  21.7 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.08 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25.29 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>