264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2558 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  99.75 
 
 		 393 aa  784    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  784    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  784    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  64.9 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  38.21 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  38.21 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  38.21 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  38.21 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  37.67 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  37.94 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 395 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  40.21 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  40.21 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  40.21 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  40.21 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  37.3 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  36.93 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  34.65 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  32.47 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.76 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.2 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.63 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.35 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  27.76 
 
 		 434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  27.4 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  25.69 
 
 		 442 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  27.04 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.17 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.73 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 395 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 424 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.28 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.36 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  23.36 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  23.36 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.36 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.36 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.7 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.1 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.1 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.1 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.07 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  23.08 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.91 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.91 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  22.97 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  21.67 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  20.37 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.7 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  22.47 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  22.77 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.37 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  21.33 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  24.28 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.41 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>