More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3308 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  89.56 
 
 
412 aa  753    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  89.32 
 
 
412 aa  747    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  89.08 
 
 
413 aa  753    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  822    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  89.81 
 
 
412 aa  755    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  34.2 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3633  hypothetical protein  83.52 
 
 
91 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.514109 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  28.49 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3646  MFS family major facilitator transporter, sugar:cation symporter  83.84 
 
 
173 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3413  hypothetical protein  81.32 
 
 
91 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3682  hypothetical protein  81.32 
 
 
91 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  30.86 
 
 
424 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  31.32 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3374  multidrug resistance protein  77.17 
 
 
97 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.994358  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.55 
 
 
424 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  30.46 
 
 
417 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  27.92 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  27.46 
 
 
426 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
423 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  29 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  29 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  29 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  29 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.4 
 
 
423 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  28.28 
 
 
424 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  27.7 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.16 
 
 
423 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  27.46 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
392 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.77 
 
 
424 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  25.73 
 
 
407 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  26.15 
 
 
442 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.37 
 
 
423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  26.92 
 
 
427 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  25.92 
 
 
393 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  25.92 
 
 
393 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  25.92 
 
 
393 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  24.5 
 
 
432 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.74 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  24 
 
 
464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  24.64 
 
 
460 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  26.76 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  27.11 
 
 
397 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
419 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  26.15 
 
 
418 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  26.27 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  25.2 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  25.99 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  24.62 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  26.27 
 
 
418 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.47 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  26.27 
 
 
418 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  23.97 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  25.71 
 
 
418 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.97 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  23.21 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.53 
 
 
395 aa  93.6  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.74 
 
 
412 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.74 
 
 
412 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  23.71 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.82 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.5 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
395 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  24.4 
 
 
395 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.05 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  25.2 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  24.14 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  24.53 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  26.29 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.14 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.14 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  23.87 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  23.18 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  23.68 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  23.87 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  23.18 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  23.18 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.6 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.59 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  26.45 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.87 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  25.06 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  22.74 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.8 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  26.14 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  27.08 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  25.06 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>