225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2847 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  100 
 
 		 427 aa  856    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  67.96 
 
 		 442 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  68.54 
 
 		 426 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  62.47 
 
 		 460 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  62.66 
 
 		 464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  63.12 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  62.58 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  66.9 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  34.35 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  33.66 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.77 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  27.73 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.09 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.72 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.72 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.87 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 404 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.76 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  24.44 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  24.51 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.33 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  20.71 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  23.63 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  23.35 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  23.35 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  23.35 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  20.99 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  21.41 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.61 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.92 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.17 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  20.72 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  21.53 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  20.19 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  20.19 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  21.39 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.2 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  21.66 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  21.94 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  20.24 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  19.95 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  21.66 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  22.93 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  20.24 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  22.93 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.11 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  22.93 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  22.93 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  22.67 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.38 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  22.93 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  21.48 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  23.17 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  23.17 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  22 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  26.9 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  23.68 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  23.68 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.38 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.18 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.13 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>