205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2765 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
397 aa  795    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  65.15 
 
 
399 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  54.06 
 
 
397 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  55.24 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  55.24 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  55.24 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  55.24 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  55.24 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  55.24 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  54.99 
 
 
397 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  54.99 
 
 
397 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  53.81 
 
 
397 aa  428  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  54.99 
 
 
397 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  46.31 
 
 
404 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  47.95 
 
 
393 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  47.95 
 
 
393 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  36.04 
 
 
416 aa  243  5e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
407 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  33.95 
 
 
400 aa  216  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  32.81 
 
 
398 aa  209  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  30.7 
 
 
438 aa  186  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  31.75 
 
 
410 aa  176  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.86 
 
 
423 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.58 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.35 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.08 
 
 
423 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.7 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  26.54 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.46 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
424 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
423 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.07 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.48 
 
 
424 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.91 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.13 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  25.7 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.29 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.1 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.89 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.07 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.86 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.4 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.29 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.55 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.15 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  23.13 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.54 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  26.15 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  25.07 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  24.11 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  26.2 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  25.17 
 
 
432 aa  67  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  23.16 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  22.03 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.38 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.51 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.22 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.69 
 
 
418 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  24.7 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  24.11 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  22.77 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  23.06 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.96 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  22.22 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  22.22 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  22.22 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.56 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.42 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
452 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  23.5 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  25.85 
 
 
460 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  23.85 
 
 
416 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
464 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  22.51 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25.85 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.26 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  25.85 
 
 
464 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  20.41 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>