91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0136 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
401 aa  806    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  40.35 
 
 
410 aa  292  8e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  31.81 
 
 
398 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  29.2 
 
 
404 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  28.91 
 
 
393 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  28.91 
 
 
393 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  26.67 
 
 
416 aa  153  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  27.99 
 
 
397 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  27.99 
 
 
397 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  27.99 
 
 
397 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  27.99 
 
 
397 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  28.42 
 
 
397 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  27.99 
 
 
397 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
397 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  27.99 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  27.22 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  27.99 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  27.99 
 
 
397 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  27.87 
 
 
397 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  27.99 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  27.03 
 
 
400 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
399 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
407 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.51 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.65 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.82 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.61 
 
 
416 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.2 
 
 
424 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.88 
 
 
424 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.55 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.55 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.55 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.69 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.55 
 
 
423 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  30 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
423 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  29.23 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
423 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  23.58 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  22.58 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  24.38 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.39 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0753  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  21.61 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  21.13 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  21.41 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.25 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  23.93 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  22.76 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  19.74 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.58 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  22.97 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  19.89 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.52 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  21.26 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  20.69 
 
 
391 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  22.59 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.59 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  34.83 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  22.13 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  21.24 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  22.13 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  20.05 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  21.43 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  19.81 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  21.89 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  20.98 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1566  major facilitator transporter  24.38 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  20.73 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  32.99 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  32.99 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.26 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  19.62 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  19.62 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  19.35 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  17.87 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.26 
 
 
393 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  20.73 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  20 
 
 
416 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  21.95 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  20.73 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  21.95 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.22 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.56 
 
 
393 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  21.1 
 
 
389 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>