198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0013 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  801    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  42.97 
 
 		 438 aa  285  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  37.69 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  35.44 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  34.94 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  34.94 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  34.94 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  34.94 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  34.94 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  34.94 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  34.94 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  34.57 
 
 		 404 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  34.94 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  30.88 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  27.03 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  23.98 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.37 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.46 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.73 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.25 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  21.5 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  23.68 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.46 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  21.95 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  24.13 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  20.99 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  20.45 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.73 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.58 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.57 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.66 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.28 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.74 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  23.1 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  20.29 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  22.49 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  22.49 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  23.23 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  23.12 
 
 		 489 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  20.1 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  20.1 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  22.49 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.39 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  22.89 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  21.5 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  24.94 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  22.75 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  23.5 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  22.53 
 
 		 489 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>