More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0334 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  84.22 
 
 		 450 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  46.64 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 		 445 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 412 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  39.34 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  31.84 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.45 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26 
 
 		 424 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 420 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.18 
 
 		 424 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  27.99 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  28.05 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 428 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 418 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.78 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.78 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  24.05 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  24.05 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 418 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 418 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  28.74 
 
 		 405 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 407 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 408 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 1075 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  24.68 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  25.37 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.31 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.31 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.31 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.37 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.31 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.37 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  25.37 
 
 		 397 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  28.57 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  24.73 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25.31 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.01 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  24.88 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  27.22 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  26.54 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  26.23 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.65 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  27.22 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  22.86 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  26.54 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  26.54 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  26.23 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.13 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>