127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0144 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 438 aa  886    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 400 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  36.99 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  33.79 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  32.83 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 397 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  30.31 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  30.31 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  30.31 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  30.05 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  30.31 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  30.05 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  30.33 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  30.31 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  30.31 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  27.81 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.86 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  26 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.94 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  20.05 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.23 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  22.25 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.94 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.09 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.15 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.12 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  20.61 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.19 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  20.79 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  22.96 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  19.6 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  19.6 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  19.6 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  19.6 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  19.89 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  19.89 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  20.05 
 
 		 424 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  23.48 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  20.37 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  20.97 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  19.07 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.07 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  19.37 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  19.28 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  21.23 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  19.07 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  19.07 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  19.77 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  20 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  21.83 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  20.72 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  20.91 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0549  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0563  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000011277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 525 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  20.47 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  19.71 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  19.85 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  19.59 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>