More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2223 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 450 aa  249  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  42.94 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  40.91 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 398 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 416 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  30.59 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.17 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.93 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  28.24 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 424 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  27.29 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.18 
 
 		 423 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  29.72 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.41 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 421 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 428 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.69 
 
 		 397 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.68 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.75 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.75 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.75 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.75 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.38 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.4 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.62 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.62 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.51 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.8 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.4 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.17 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.08 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.97 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  21.13 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.15 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.74 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  23.77 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  20.83 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  24.02 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  24.02 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  24.02 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  23.04 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.4 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  24.28 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  24.02 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  23.76 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  20.66 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  20.25 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.5 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  20.25 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  23.82 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>