More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7743 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  56.22 
 
 
471 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  35.88 
 
 
412 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  37.43 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  37.64 
 
 
398 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
419 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  36.48 
 
 
450 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
419 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  37.14 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  36.27 
 
 
450 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  35.97 
 
 
416 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
445 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
433 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.73 
 
 
423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.73 
 
 
423 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.07 
 
 
424 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  31.16 
 
 
432 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  28.18 
 
 
423 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  28.18 
 
 
423 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  28.18 
 
 
423 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.9 
 
 
423 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  28.18 
 
 
423 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.2 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
423 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  27.42 
 
 
423 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
419 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
422 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.8 
 
 
424 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.39 
 
 
424 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
426 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  26.05 
 
 
402 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
415 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
396 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.93 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  24.09 
 
 
418 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.89 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.89 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.03 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.88 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.23 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.82 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.97 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.91 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.91 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  25.09 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.24 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.07 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.73 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10859  integral membrane protein  29.51 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000464176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.39 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.39 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.2 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.39 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.39 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.39 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.12 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.12 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.12 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  25.2 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.49 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.54 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23.43 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  23.08 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  21.99 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  20.78 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  20.78 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  20.22 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.55 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.77 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.63 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.78 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  24.14 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.85 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.43 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26.41 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  21.94 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  20.71 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  21.94 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20 
 
 
412 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  25.09 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>