More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0267 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  878    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  40.49 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  34.35 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  34.43 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 460 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 464 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  29.48 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  31.07 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  28.61 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  28.61 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  28.61 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.17 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.93 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  24.05 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  24.05 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  23.78 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  24.93 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  23.78 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  25.99 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  25.27 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  25.27 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  25.27 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  23.76 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  25.27 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.51 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.34 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.34 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.93 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  25.68 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.51 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.51 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.24 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.51 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.26 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  26.39 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.57 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  22.39 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  22.55 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.89 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.79 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.86 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  22.63 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.39 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.39 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  21.39 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  23.2 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  21.36 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.15 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.58 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.65 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.45 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>