212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1844 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
409 aa  820    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  36.16 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  36.41 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  35.91 
 
 
418 aa  272  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  36.16 
 
 
418 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  36.41 
 
 
418 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  35.91 
 
 
418 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  35.66 
 
 
418 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  35.66 
 
 
418 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  33.25 
 
 
418 aa  210  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  28.93 
 
 
417 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  27.39 
 
 
406 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  28.68 
 
 
416 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
421 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  25.85 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  27.21 
 
 
416 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  27.21 
 
 
416 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.89 
 
 
395 aa  96.3  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06064  hypothetical protein  24.27 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.27 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.74 
 
 
423 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.74 
 
 
423 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.74 
 
 
423 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.74 
 
 
423 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.74 
 
 
423 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.73 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.74 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.11 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.87 
 
 
424 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
445 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.47 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  25.28 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.49 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
419 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.73 
 
 
424 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.41 
 
 
417 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.23 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.79 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  23.86 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  23.23 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  23.23 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  23.23 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  23.23 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  23.23 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  24.85 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  23.55 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.78 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.97 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.8 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  23.66 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 
452 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  25.33 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  25.33 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  23.72 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  22.32 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.33 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.76 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.99 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  26.55 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  21.33 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  21.33 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.26 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  22.29 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  22.29 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  22.9 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  22.29 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  20.87 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  22.9 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.51 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  21.94 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  23.77 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  22.51 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.01 
 
 
416 aa  67  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.13 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  21.43 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  23.5 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  20.79 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  20.79 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  20.79 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  23.1 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  23.25 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.02 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
419 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  22.55 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.23 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.32 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>