More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2464 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  832    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  38.21 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  29.66 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  30.87 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  31.27 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  29.32 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.81 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  27.42 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 393 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  26.61 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  26.61 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 407 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  26.61 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  26.34 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  26.39 
 
 		 397 aa  123  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  26.27 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  26.27 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  26.27 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  26.27 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  26.01 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.17 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.37 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  25.54 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  25.47 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.11 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.09 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  26.82 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  21.26 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.26 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 464 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.34 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  21.26 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  21.03 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  25.41 
 
 		 409 aa  86.3  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  23.14 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  23.27 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  20.99 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.08 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.81 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  19.65 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  20.54 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  20.54 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.82 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.4 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  24.09 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  20.81 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  23.05 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  22.77 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.57 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.51 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  22.77 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  22.77 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.57 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  22.77 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.57 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.51 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  22.61 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.71 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>