291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2859 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  100 
 
 
381 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  43.09 
 
 
407 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 
392 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  41.08 
 
 
404 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  40.69 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  39.53 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  39.53 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  39.27 
 
 
393 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  40.21 
 
 
406 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0557908 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
395 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  31.64 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  31.64 
 
 
395 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  31.64 
 
 
395 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  31.64 
 
 
395 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  31.64 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  32.49 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  32.25 
 
 
395 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  33.15 
 
 
395 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  32.98 
 
 
405 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  32.87 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  32.87 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  32.87 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  31.92 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  28.65 
 
 
417 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.46 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.18 
 
 
412 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25.77 
 
 
412 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.74 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.7 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.5 
 
 
434 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  26.61 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.49 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.7 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.84 
 
 
424 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
423 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  24.68 
 
 
442 aa  90.5  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.73 
 
 
395 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  26.47 
 
 
450 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
423 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  24.48 
 
 
426 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.44 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  23.85 
 
 
427 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.71 
 
 
423 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  23.78 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.82 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.82 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.22 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.22 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.37 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  21.82 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.82 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25.73 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  24.86 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.54 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.94 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  20.39 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  20.83 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  22.03 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  20.51 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  20.28 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  19.83 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.87 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.35 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.35 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  24.15 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  24.55 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.84 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.84 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  22.19 
 
 
432 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 
412 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.41 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  26.33 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  23.22 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.44 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.32 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  25.94 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  26.19 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.32 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  29.85 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
428 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.18 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  23.27 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  30.41 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  30.41 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  27.27 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>