30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06064 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06064  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  798    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  25.48 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  25.21 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  25.21 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  24.93 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  25.64 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.27 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  23.24 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  22.62 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  23.37 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  27.33 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.42 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  21.41 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  20.38 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  25.43 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>