169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2124 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  99.49 
 
 		 395 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  99.24 
 
 		 395 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  96.96 
 
 		 395 aa  737    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  99.75 
 
 		 395 aa  781    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  99.24 
 
 		 395 aa  776    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  100 
 
 		 395 aa  782    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  97.97 
 
 		 395 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  99.49 
 
 		 395 aa  780    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  76.96 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 		 395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  68.62 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  29.49 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.89 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.78 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.26 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.3 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25.33 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.35 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.33 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  22.25 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.82 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.3 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  22.53 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  22.28 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  22.93 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  23.72 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.42 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  23.05 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  23.33 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  20.11 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.05 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.74 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  19.66 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  20.62 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  23.8 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.04 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.28 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  20.85 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.28 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>