More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0189 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  791    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  34.36 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 471 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  26.49 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  22.9 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.6 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.67 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.6 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  22.9 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  23.23 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  22.38 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.41 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  22.38 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  22.53 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.92 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.21 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.16 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.67 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  20.7 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  21.1 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  19.77 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  20.35 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  20.35 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  20.54 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  28.39 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  31.43 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  20.85 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.59 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 		 511 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  27.41 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  28.86 
 
 		 468 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 452 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>