213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1043 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  100 
 
 
440 aa  865    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  30.72 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  28.17 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  32.99 
 
 
400 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  33.18 
 
 
398 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2906  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0739227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0342  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.93 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  32.93 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  31.9 
 
 
486 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  30.06 
 
 
486 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  31.29 
 
 
486 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  30.06 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  30.06 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  20.88 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  30.06 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.16 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  36.8 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.45 
 
 
516 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
485 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
528 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1222  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
436 aa  53.5  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.19 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.88 
 
 
406 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.6 
 
 
424 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  29.18 
 
 
409 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  21.56 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
421 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2920  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  0.655639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  33.6 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
395 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  30.86 
 
 
480 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.01 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.01 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.28 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.15 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.94 
 
 
418 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
587 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  25.57 
 
 
437 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  29.76 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  28.82 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  33.33 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  30.3 
 
 
491 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.48 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.39 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  32.84 
 
 
489 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  28.36 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  29.1 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.91 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.12 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.8 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.98 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  29.1 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.48 
 
 
409 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.98 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  33.12 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.09 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 
592 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.28 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.56 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.25 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.71 
 
 
1833 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  27.81 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.75 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.53 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  23.58 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  25.69 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  24.9 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  28.36 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.68 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  21.63 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  29.27 
 
 
480 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  33.83 
 
 
489 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.78 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  30.43 
 
 
553 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  20.28 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.36 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.36 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  29.94 
 
 
582 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  29.58 
 
 
500 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>