61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0342 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0342  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
421 aa  848    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2906  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
415 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0739227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1222  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
436 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1097  hypothetical protein  35.09 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  23.73 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  22.67 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  20.41 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  22.07 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  22.31 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  29.63 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  21.88 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.52 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  25.45 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.42 
 
 
429 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.94 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.61 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  21.99 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  31.97 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  23.44 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.1 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  28.12 
 
 
412 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  25.37 
 
 
416 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.77 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.36 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.79 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  20.71 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  31.03 
 
 
624 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  21.05 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  28.08 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.57 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.87 
 
 
474 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  27.78 
 
 
591 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  26.74 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  26.74 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  19.17 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.33 
 
 
413 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  26.74 
 
 
428 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  19.17 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.61 
 
 
386 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.71 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.06 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  32.89 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  21.56 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  37.29 
 
 
451 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  37.31 
 
 
410 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
396 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  37.31 
 
 
410 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 
451 aa  43.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  37.31 
 
 
410 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>