56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2155 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  99.76 
 
 
410 aa  817    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  99.76 
 
 
410 aa  817    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  23.31 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  23.81 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  28.36 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.7 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  30.19 
 
 
445 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  29.32 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  29.32 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
516 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.24 
 
 
440 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  25.46 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
511 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  26.78 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
462 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4235  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
417 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  36.73 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
462 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  28.65 
 
 
429 aa  46.6  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  28.41 
 
 
582 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  30.22 
 
 
480 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  25.8 
 
 
537 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4711  major facilitator superfamily transporter  30.17 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  30.17 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.36 
 
 
465 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.62 
 
 
424 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.36 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0741  major facilitator transporter  31.71 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.662794  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  24.22 
 
 
466 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.62 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.62 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0295  major facilitator superfamily transporter  28.1 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4065  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0342  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  27.12 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.51 
 
 
522 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>