49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0225 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  796    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  84.77 
 
 		 399 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  81.77 
 
 		 406 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  65.3 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  54.59 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0188  hypothetical protein  78.38 
 
 		 114 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  23.84 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  27.74 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  32.2 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  30.6 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  21.94 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  25 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  25 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  33.09 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>