43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0235 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
424 aa  848    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  25.65 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  24.39 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  26.89 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  26.89 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  24.92 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  22.08 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  24.92 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  24.92 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  24.21 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 
403 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  23.14 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  20.43 
 
 
402 aa  53.9  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 
417 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  22.09 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  22.49 
 
 
393 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
451 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  21.94 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  29.51 
 
 
445 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.16 
 
 
410 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  19.81 
 
 
440 aa  46.6  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  25.11 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.24 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.72 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  28.36 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.62 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  21.83 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  23.57 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  39.34 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  26.67 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.28 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  27.04 
 
 
461 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
406 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.87 
 
 
408 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
367 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>