21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3300 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
451 aa  872    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  56.13 
 
 
418 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  55.15 
 
 
417 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  55.64 
 
 
419 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  26.54 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  25.17 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
402 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  27.1 
 
 
399 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
408 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  23.67 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
390 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  24.32 
 
 
389 aa  53.5  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
406 aa  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  34.52 
 
 
310 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  26.8 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  27.33 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  29.66 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  24.32 
 
 
402 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>