88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0910 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
390 aa  760    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  26.89 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  25 
 
 
409 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  25 
 
 
409 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  24.36 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  25.14 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  24.41 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.03 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  29.92 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  23.24 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 
417 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  26.15 
 
 
436 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  20.88 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  21.87 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.43 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  24.22 
 
 
440 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  28.74 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  26.83 
 
 
434 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.74 
 
 
444 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  20.6 
 
 
408 aa  49.7  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.1 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  25.1 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  22.37 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1077  hypothetical protein  30.84 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.69 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  28.99 
 
 
445 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.71 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  23.32 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  23.08 
 
 
479 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
367 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
398 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  24.1 
 
 
433 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  28.12 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  22.61 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  24.77 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.69 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.69 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  28 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  30.3 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  28 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  21.09 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  28 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  23.2 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.31 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  19.84 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  24.27 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  24.64 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  24.27 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  28.72 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  22.29 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  26.74 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  22.67 
 
 
458 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  22.01 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.46 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  27.34 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  22.77 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.97 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  27.34 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  26.36 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  21.97 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  28.93 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  26.36 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  31.19 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  26.85 
 
 
418 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.59 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.59 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.59 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.23 
 
 
426 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.59 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>