50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0869 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  871    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 464 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  26.02 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 406 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  31.18 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  31.18 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  31.18 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  25.81 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  27.13 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1077  hypothetical protein  28.46 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  31.73 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.12 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.12 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  43.4 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  24 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  40.35 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  42.59 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  42.59 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  26.32 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>