37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1823 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  100 
 
 		 464 aa  873    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  75.22 
 
 		 456 aa  594  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  29.65 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  27.08 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  27.25 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  21.47 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  41.49 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  27.31 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  30.43 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  24.35 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  21.1 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>