32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2715 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  807    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  75.37 
 
 		 417 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  71.6 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  56.13 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  27.46 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  29.53 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  20.4 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  30.08 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  24.81 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>