52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0249 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  791    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  84.77 
 
 
402 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  81.73 
 
 
406 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  65.81 
 
 
399 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  55.12 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 
408 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0188  hypothetical protein  80.56 
 
 
114 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
402 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  30.26 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.35 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  26.39 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  22.14 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  27.1 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  27.1 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  27.1 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  31.37 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
402 aa  57  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
417 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  28.36 
 
 
310 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  26.46 
 
 
464 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  30.56 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  27.38 
 
 
456 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  31.47 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  30.56 
 
 
391 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  30.56 
 
 
391 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.23 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  25.86 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.62 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  36.99 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  34.25 
 
 
513 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  30 
 
 
327 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  20.93 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  35.62 
 
 
513 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  23.83 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  23.83 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  25.1 
 
 
443 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  32.43 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  25.79 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.77 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  24.36 
 
 
383 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  29.37 
 
 
464 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
390 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>