33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1049 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  58.01 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  51.91 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 434 aa  229  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  44.44 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  32.26 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  29.1 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  20.81 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  28.27 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  25.14 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  18.04 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  29.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  29.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  29.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>