31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3395 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
408 aa  810    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  65.44 
 
 
393 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  55.3 
 
 
399 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  54.22 
 
 
399 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  53.98 
 
 
406 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  52.28 
 
 
402 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0188  hypothetical protein  58.21 
 
 
114 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  21.74 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.74 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  25.47 
 
 
409 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  25.28 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  30.4 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  29.53 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  26.05 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  21.45 
 
 
406 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.48 
 
 
539 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  27.73 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
367 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
451 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>