66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2738 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  100 
 
 
510 aa  1018    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  55.49 
 
 
518 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
551 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  53.11 
 
 
551 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  53.11 
 
 
551 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  53.11 
 
 
551 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  54.53 
 
 
531 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  54.64 
 
 
531 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  54.6 
 
 
529 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  53.95 
 
 
505 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  54.24 
 
 
531 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  52.71 
 
 
530 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  51.19 
 
 
507 aa  529  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  51.82 
 
 
551 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  53.71 
 
 
524 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  51.27 
 
 
519 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  52.54 
 
 
502 aa  521  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  51.12 
 
 
501 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  56.34 
 
 
514 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  57.06 
 
 
495 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  50.3 
 
 
502 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  52.85 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  51.71 
 
 
500 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
457 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  44.29 
 
 
441 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
509 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  39.25 
 
 
493 aa  355  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  57.75 
 
 
448 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  34.8 
 
 
443 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  32.09 
 
 
448 aa  240  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
457 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  31.59 
 
 
457 aa  227  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  45.3 
 
 
498 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  31.15 
 
 
453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  46.67 
 
 
428 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  40.34 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  39.32 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  38.89 
 
 
450 aa  173  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  39.25 
 
 
453 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  39.82 
 
 
454 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  41.51 
 
 
458 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  34.55 
 
 
471 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  34.3 
 
 
461 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  26.83 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.57 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
460 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 
435 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  28.93 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  31.21 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  34.85 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.57 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
415 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  26.85 
 
 
416 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.61 
 
 
456 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.49 
 
 
353 aa  47  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  32 
 
 
404 aa  47  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.24 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  37.1 
 
 
461 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
423 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.19 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
674 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.09 
 
 
475 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  27.45 
 
 
428 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.44 
 
 
493 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>