43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0873 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  810    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  79.56 
 
 
419 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  75.37 
 
 
418 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  55.15 
 
 
451 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  26.27 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
437 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  27.04 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  20.39 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
428 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  25.3 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  27.53 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  26.61 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  25.75 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  36.31 
 
 
399 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  26.53 
 
 
409 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 
411 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  28.06 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  25.92 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  26.19 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  23.29 
 
 
387 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  22.62 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  27.92 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  34 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  22.92 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  22.89 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  22.92 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  22.92 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  22.92 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  22.92 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  26.47 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  22.82 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  22.82 
 
 
409 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
434 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  22.92 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>