15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0600 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  832    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0019  major facilitator superfamily permease  22.22 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.284837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  22.69 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>