26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1442 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  29.33 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  24.8 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  20.4 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  22.64 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  20.66 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  23.24 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>