33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0263 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 367 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  43.68 
 
 		 428 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 414 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 434 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  40.5 
 
 		 374 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 409 aa  86.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  31.18 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  35.84 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  23.63 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  30.4 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  29.1 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  30.91 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>