48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3520 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  822    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  41.32 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  42.96 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  31.11 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  35.77 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  31.71 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4235  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  33.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  33.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  33.6 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 409 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  40 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  40 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  40 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  40 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2714  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0501546  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  38.82 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>