20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0307 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  794    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  49.22 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  40.16 
 
 		 374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  37.38 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  33.87 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  28.79 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  21.43 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>