30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2558 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  58.29 
 
 		 428 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  50.98 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 414 aa  272  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 367 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  45.31 
 
 		 374 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  37.96 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  29.26 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  31.91 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.86 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4235  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1077  hypothetical protein  19.66 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>