41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1343 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  100 
 
 		 374 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  43.92 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  37.61 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 456 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.81 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  40 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  28.37 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  31.62 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  26.76 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  26.76 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  25.78 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  25.78 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  32.69 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  32.06 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  18.72 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>