84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 403 aa  758    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  42.52 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  41.3 
 
 		 690 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  42.35 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  35.1 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  33.6 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  29.11 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  27.71 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.16 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.03 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  25.26 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  28.16 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  27.61 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  27.61 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  27.16 
 
 		 435 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0052  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0533756  normal  0.852382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.79 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  20.07 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.13 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.19 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  20.07 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.11 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  21.36 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.13 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  19.01 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  32.72 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.72 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  20.77 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  20.98 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.94 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.94 
 
 		 503 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>