16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 441 aa  811    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  33.17 
 
 		 690 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  29.86 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  29.11 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  32.06 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  31.61 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  29.65 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>