55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3049 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 412 aa  783    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  54.55 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  44.85 
 
 		 690 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  41.99 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  44.62 
 
 		 432 aa  196  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  38.19 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  34.04 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  30.43 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.78 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.77 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.15 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.15 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.15 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0052  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0533756  normal  0.852382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.15 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.15 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  28.43 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  20.48 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  21.45 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2611  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  22.94 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  27.16 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  27.16 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  27.16 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  28 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  24.37 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5283  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 515 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280334  normal  0.245344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>