54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 437 aa  812    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 393 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  33.01 
 
 		 690 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  35.93 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  37.78 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  33.96 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  28.92 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  29.86 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  30 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  28.52 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.95 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.38 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  27.22 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  27.67 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  27.67 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  27.67 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  25.31 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  27.67 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  27.67 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  27.67 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  29.71 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.86 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.96 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.96 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>