100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3164 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  770    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  80.25 
 
 		 405 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  54.91 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  42.01 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  43.85 
 
 		 690 aa  252  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  45.15 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  38.11 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  34.91 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  30.64 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.92 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.79 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.3 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  23.26 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.21 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.23 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.11 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.11 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.9 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.11 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.11 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  28 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  25.4 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.672028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  34.27 
 
 		 409 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  20.73 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.91 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  22.99 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87108  Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter)  29.41 
 
 		 635 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.132654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.91 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.59 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  21.43 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.99 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.99 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  23.43 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  23.04 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  19.76 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 462 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  21.1 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.67 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>